Souvent qualifié d’«organe caché», le microbiote est un écosystème complexe et diversifié qui joue un rôle crucial dans le maintien de l’équilibre de notre organisme. Composé d’environ 100 000 milliards de microorganismes, incluant bactéries, virus, champignons et archées, le microbiote intestinal pèse jusqu’à 2 kg chez l’adulte et est essentiel à notre bonne santé.
Composition et Caractéristiques du Microbiote
Le microbiote intestinal est unique à chaque individu et se caractérise par sa diversité et sa richesse. La composition du microbiote se stabilise vers l’âge de 3 ans et varie le long du tube digestif, avec une concentration particulièrement élevée dans le côlon. Un microbiote sain est marqué par une représentation équilibrée des différentes familles de micro-organismes et une grande variété d’espèces.
Il existe d’autres types de microbiotes dans l’organisme humain que sont :
le microbiote cutané, le microbiote génital, le microbiote buccal.
Rôles Physiologiques Majeurs du Microbiote
Le microbiote remplit plusieurs fonctions vitales pour la santé de l’hôte
Fonctionnement Digestif : Il est fondamental pour le fonctionnement du tractus digestif, convertissant une grande variété de substrats comme les glucides, les protéines et les lipides en métabolites bénéfiques. La dégradation des fibres en acides gras à chaîne courte (AGCC) favorise la diversité et la stabilité du microbiote.
Barrière Physique : Le microbiote constitue la première ligne de défense contre les agents pathogènes, agissant avant la couche de mucus et contribuant à l’imperméabilité de la barrière intestinale.
Immunité : Il est essentiel au développement et à la maturation du système immunitaire, interagissant constamment avec celui-ci et l’épithélium intestinal pour transmettre des informations cruciales.
Production d’Énergie : Le microbiote améliore la fonction mitochondriale, cruciale pour la production d’énergie nécessaire à la digestion.
Interactions avec d’Autres Systèmes Corporels
L’influence du microbiote s’étend bien au-delà du système digestif, impactant d’autres fonctions corporelles :
Axe Intestin-Cerveau : Le microbiote communique en permanence avec le cerveau par des voies neurologiques, endocrines, métaboliques et immunitaires. Le système nerveux entérique, souvent appelé « deuxième cerveau », est étroitement connecté au cerveau, influençant les états mentaux et émotionnels.
Santé Cardiovasculaire : Le microbiote peut produire de la triméthylamine (TMA) à partir de la choline et de la carnitine, qui est ensuite oxydée en triméthylamine-N-oxyde (TMAO) dans le foie. Le TMAO est prothrombotique et peut entraîner une inflammation, contribuant ainsi aux maladies cardiovasculaires.
Épigénétique : Le microbiote peut influencer l’épigénétique, c’est-à-dire les mécanismes qui définissent comment les gènes sont utilisés par une cellule sans modifier la séquence d’ADN. Cela peut contribuer au développement de maladies humaines, notamment les cancers.
Facteurs Influencant le Microbiote
La composition et la fonction du microbiote sont modulées par une multitude de facteurs :
Alimentation : Une alimentation riche en fibres et en « bons gras » est recommandée pour maintenir un microbiote sain. Les aliments ultra-transformés peuvent nuire au microbiote 1.
Génétique, Environnement, Âge : Ces facteurs jouent également un rôle crucial dans la composition du microbiote.
Antibiotiques : Leur prise peut modifier la composition du microbiote et réduire l’expression des peptides antimicrobiens, entraînant une dysbiose.
Périnatalité : Le microbiote maternel, le mode d’accouchement, l’allaitement et les infections sont des facteurs clés pour la colonisation du nourrisson.
Stress et Sommeil : Ces facteurs peuvent également influencer la composition du microbiote.
Activité Physique : Elle peut améliorer la diversité du microbiote et accroître l’accès au système nerveux parasympathique, améliorant le péristaltisme, l’absorption et la fonction mitochondriale.
Liens avec les Pathologies et Dysfonctionnements
Un déséquilibre du microbiote, ou dysbiose, est associé à de nombreuses pathologies, souvent qualifiées de maladies de civilisation :
Maladies Inflammatoires Chroniques de l’Intestin (MICI) : La dysbiose est souvent observée dans ces maladies.
Cancer : Des anomalies épigénétiques, influencées par l’environnement (incluant le microbiote), contribuent au développement et à la progression des cancers .
Syndrome de l’Intestin Irritable (SII) : Il existe une corrélation fréquente entre les problèmes psychiatriques et le SII.
Maladies Cardiovasculaires (MCV) : Le statut inflammatoire et prothrombotique, ainsi que des facteurs de risque métaboliques, sont liés et interagissent avec le microbiote .
Soutien et Prise en Charge
La prise en charge des déséquilibres du microbiote s’inscrit souvent dans une approche fonctionnelle et holistique (consulter un-e professionnel-le):
Alimentation : L’éviction d’aliments potentiellement problématiques suivie d’une réintroduction progressive est souvent recommandée.
Probiotiques et Prébiotiques : Utiles pour soutenir l’écosystème intestinal.
Compléments Alimentaires : Ils peuvent renforcer la barrière intestinale, soutenir la fonction digestive et apporter des probiotiques.
Mode de Vie : L’activité physique, la gestion du stress et du sommeil sont essentielles pour maintenir un microbiote sain.
Conclusion
Le microbiote intestinal est un acteur central et dynamique de la santé, dont l’équilibre est influencé par un vaste ensemble de facteurs liés au mode de vie et à l’environnement. La reconnaissance de son rôle fondamental pousse vers une médecine plus holistique, personnalisée et participative, intégrant les avancées scientifiques avec des approches complémentaires pour soutenir les capacités d’auto-guérison de l’individu.
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